Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Pprc1Q6NZN1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pprc1Q6NZN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pprc1Q6NZN1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pprc1Q6NZN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pprc1Q6NZN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pprc1Q6NZN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pprc1Q6NZN1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms