Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Soga3Q6NZL0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Soga3Q6NZL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Soga3Q6NZL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Soga3Q6NZL0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga3Q6NZL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Soga3Q6NZL0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Soga3Q6NZL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Soga3Q6NZL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms