Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rprd2Q6NXI6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rprd2Q6NXI6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rprd2Q6NXI6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rprd2Q6NXI6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rprd2Q6NXI6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rprd2Q6NXI6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms