Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tvp23aQ6NVH0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tvp23aQ6NVH0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tvp23aQ6NVH0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tvp23aQ6NVH0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23aQ6NVH0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms