Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frem2Q6NVD0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frem2Q6NVD0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frem2Q6NVD0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Frem2Q6NVD0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms