Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pdcd11Q6NS46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pdcd11Q6NS46 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Pdcd11Q6NS46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Pdcd11Q6NS46 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Pdcd11Q6NS46 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pdcd11Q6NS46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pdcd11Q6NS46 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms