Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc66Q6NS45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc66Q6NS45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc66Q6NS45 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc66Q6NS45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc66Q6NS45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc66Q6NS45 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms