Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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