Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep78Q6IRU7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep78Q6IRU7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep78Q6IRU7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms