Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpm4Q6IRU2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpm4Q6IRU2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpm4Q6IRU2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tpm4Q6IRU2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm4Q6IRU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms