Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt39Q6IFX4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt39Q6IFX4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt39Q6IFX4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Krt39Q6IFX4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt39Q6IFX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt39Q6IFX4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms