Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KdsrQ6GV12 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KdsrQ6GV12 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KdsrQ6GV12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KdsrQ6GV12 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KdsrQ6GV12 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms