Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Edrf1Q6GQV7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Edrf1Q6GQV7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Edrf1Q6GQV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Edrf1Q6GQV7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Edrf1Q6GQV7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms