Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
Smarca2Q6DIC0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Smarca2Q6DIC0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Smarca2Q6DIC0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca2Q6DIC0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca2Q6DIC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Smarca2Q6DIC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Smarca2Q6DIC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
Smarca2Q6DIC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Smarca2Q6DIC0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Smarca2Q6DIC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Smarca2Q6DIC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Smarca2Q6DIC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Smarca2Q6DIC0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms