Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFY8

Brinp2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp2Q6DFY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brinp2Q6DFY8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brinp2Q6DFY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brinp2Q6DFY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brinp2Q6DFY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brinp2Q6DFY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brinp2Q6DFY8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms