Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFU8

Zfp948, Zinc finger protein 948, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp948Q6DFU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp948Q6DFU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp948Q6DFU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Zfp948Q6DFU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Zfp948Q6DFU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Zfp948Q6DFU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Zfp948Q6DFU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp948Q6DFU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp948Q6DFU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms