Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Prex1Q69ZK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prex1Q69ZK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Prex1Q69ZK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Prex1Q69ZK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Prex1Q69ZK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prex1Q69ZK0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Prex1Q69ZK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Prex1Q69ZK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms