Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msl2Q69ZF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msl2Q69ZF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Msl2Q69ZF8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msl2Q69ZF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Msl2Q69ZF8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms