Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tm4sf1Q64302 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tm4sf1Q64302 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tm4sf1Q64302 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tm4sf1Q64302 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tm4sf1Q64302 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm4sf1Q64302 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm4sf1Q64302 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tm4sf1Q64302 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tm4sf1Q64302 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms