Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zic2Q62520 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zic2Q62520 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zic2Q62520 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zic2Q62520 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zic2Q62520 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms