Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Vil1Q62468 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Vil1Q62468 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Vil1Q62468 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Vil1Q62468 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Vil1Q62468 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Vil1Q62468 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vil1Q62468 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Vil1Q62468 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Vil1Q62468 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Vil1Q62468 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms