Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vil1Q62468 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vil1Q62468 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vil1Q62468 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vil1Q62468 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vil1Q62468 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vil1Q62468 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms