Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sp4Q62445 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp4Q62445 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sp4Q62445 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sp4Q62445 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sp4Q62445 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 718.2 ms