Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3gl2Q62420 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl2Q62420 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3gl2Q62420 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3gl2Q62420 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms