Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sorbs1Q62417 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sorbs1Q62417 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sorbs1Q62417 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sorbs1Q62417 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sorbs1Q62417 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sorbs1Q62417 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms