Protein–RNA interactions for Protein: Q62406

Irak1, Interleukin-1 receptor-associated kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak1Q62406 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irak1Q62406 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irak1Q62406 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Irak1Q62406 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Irak1Q62406 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Irak1Q62406 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms