Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Kdm5dQ62240 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Kdm5dQ62240 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Kdm5dQ62240 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
Kdm5dQ62240 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
Kdm5dQ62240 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Kdm5dQ62240 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
Kdm5dQ62240 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Kdm5dQ62240 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC45.39■■■■■ 4.86
Kdm5dQ62240 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Kdm5dQ62240 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
Kdm5dQ62240 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
Kdm5dQ62240 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Kdm5dQ62240 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Kdm5dQ62240 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC45.17■■■■■ 4.82
Kdm5dQ62240 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Kdm5dQ62240 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Kdm5dQ62240 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Kdm5dQ62240 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC45.12■■■■■ 4.81
Kdm5dQ62240 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Kdm5dQ62240 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Kdm5dQ62240 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Kdm5dQ62240 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Kdm5dQ62240 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
Kdm5dQ62240 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms