Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sema3cQ62181 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3cQ62181 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3cQ62181 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sema3cQ62181 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema3cQ62181 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms