Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sin3bQ62141 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sin3bQ62141 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sin3bQ62141 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3bQ62141 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sin3bQ62141 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms