Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prg2Q61878 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg2Q61878 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg2Q61878 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prg2Q61878 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prg2Q61878 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms