Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f1Q61501 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2f1Q61501 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f1Q61501 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms