Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pde3bQ61409 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pde3bQ61409 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pde3bQ61409 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pde3bQ61409 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pde3bQ61409 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pde3bQ61409 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms