Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcolceQ61398 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PcolceQ61398 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PcolceQ61398 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PcolceQ61398 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcolceQ61398 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms