Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lamb3Q61087 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lamb3Q61087 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamb3Q61087 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamb3Q61087 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lamb3Q61087 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms