Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sim1Q61045 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sim1Q61045 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sim1Q61045 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sim1Q61045 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms