Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf3Q60980 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klf3Q60980 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klf3Q60980 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Klf3Q60980 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Klf3Q60980 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms