Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Meis1Q60954 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Meis1Q60954 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Meis1Q60954 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Meis1Q60954 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.1 ms