Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnot7Q60809 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnot7Q60809 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cnot7Q60809 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnot7Q60809 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cnot7Q60809 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms