Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f1Q60632 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr2f1Q60632 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr2f1Q60632 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f1Q60632 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms