Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec4a4Q5YIR8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec4a4Q5YIR8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec4a4Q5YIR8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms