Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf123Q5XPI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rnf123Q5XPI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rnf123Q5XPI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf123Q5XPI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rnf123Q5XPI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf123Q5XPI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf123Q5XPI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms