Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arcn1Q5XJY5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arcn1Q5XJY5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arcn1Q5XJY5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arcn1Q5XJY5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arcn1Q5XJY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arcn1Q5XJY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms