Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd5Q5VCS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd5Q5VCS6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd5Q5VCS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tdrd5Q5VCS6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tdrd5Q5VCS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd5Q5VCS6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms