Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf15Q5UBV8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf15Q5UBV8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms