Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CluhQ5SW19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CluhQ5SW19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CluhQ5SW19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CluhQ5SW19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CluhQ5SW19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CluhQ5SW19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CluhQ5SW19 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms