Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znrf3Q5SSZ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znrf3Q5SSZ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znrf3Q5SSZ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znrf3Q5SSZ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znrf3Q5SSZ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znrf3Q5SSZ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms