Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AbrQ5SSL4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AbrQ5SSL4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AbrQ5SSL4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AbrQ5SSL4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbrQ5SSL4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbrQ5SSL4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbrQ5SSL4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbrQ5SSL4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbrQ5SSL4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AbrQ5SSL4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms