Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TefmQ5SSK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TefmQ5SSK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TefmQ5SSK3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TefmQ5SSK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TefmQ5SSK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TefmQ5SSK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms