Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PkdccQ5RJI4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PkdccQ5RJI4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PkdccQ5RJI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PkdccQ5RJI4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkdccQ5RJI4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms