Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Length 794 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh12Q5RJH3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh12Q5RJH3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh12Q5RJH3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh12Q5RJH3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh12Q5RJH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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