Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm11487Q5RIS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm11487Q5RIS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm11487Q5RIS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm11487Q5RIS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm11487Q5RIS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm11487Q5RIS0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11487Q5RIS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11487Q5RIS0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm11487Q5RIS0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms